La misión de la Facultad de Recursos del Mar de la Universidad de Antofagasta es la formación de profesionales de pregrado y postgrado con sentido de pertenencia hacia la región y capaces de innovar en los campos de la oceanología, acuicultura, ecología, ciencia y tecnología de los alimentos y biotecnología. Ella integra la docencia, investigación y extensión, priviligiando al hombre, a la sociedad y al medio ambiente e imprimiendo a sus alumnos y profesionales un sello de especialidad en los temas propios de la región y la zona norte de Chile.

La Facultad busca liderazgo regional en Ciencias del Mar y de los Alimentos, ejerciendo su influencia para contribuir al desarrollo científico, cultural y económico. Para lograrlo, procura alcanzar excelencia en sus actividades, transfiere conocimientos de su competencia a los sectores público y privado, se constituye en instancia necesaria de consulta frente a los problemas del entorno, y se vincula con entidades homólogas nacionales y externas.